Individual project

Funder: German Research Foundation

Period: 2013-2018

URI: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/221270173

Detailed description: 
Der technologische Fortschritt erlaubt es, dass in vielen Naturwissenschaften experimentelle Daten schneller gewonnen werden, als sie interpretiert werden können. Aber durch den technologischen Fortschritt werden nicht nur mehr genomische Daten gewonnen, sondern es können auch gänzlich neuartige Fragestellungen bearbeitet werden, wie beispielsweise Einzelzell- oder Metagenomik-Studien. Vielen dieser Fragen ist gemein, dass das Verhältnis von Individuen innerhalb größerer Populationen betrachtet wird. Um biologische Systeme vollständig zu durchdringen, ist es daher unerlässlich, sowohl die Variation zwischen Individuen (Diversität) als auch die zeitliche Entwicklung in Populationen (Dynamik) zu verstehen. Ziel des Graduiertenkollegs ist es, Nachwuchswissenschaftlerinnen und -wissenschaftler auszubilden und in die Lage zu versetzen, neue informatische Methoden für die Analyse von Genomdiversität und -dynamik zu entwickeln. Dabei liegt der Fokus auf der Entwicklung dedizierter, neuer Algorithmen, die für das Verständnis von Genomdiversität und -dynamik notwendig sind, und auf den informatischen Paradigmen, die es zu analysieren gilt, um diese in der Praxis anzuwenden. Hieraus ergeben sich die folgenden fünf Forschungsbereiche: (1) Ausbau von Rechenkapazitäten, (2) Datenspeicherung und -abfrage, (3) Algorithmen für die Analyse von Sequenzdaten, (4) Algorithmen für die Analyse von strukturellen und Netzwerkdaten und (5) Methoden für die interaktive Analyse und Visualisierung von Ergebnissen.